由 Kexin Huang 领导的研究人员报告，他们开发出了一种通用型生物医学人工智能智能体，后者能够自主执行一系列研究任务。作者在多项案例研究中对该工具进行了测试，结果显示其性能卓越；他们表示，其研究结果指向了“一个未来：AI 智能体与研究人员协同工作，加速从基础研究到转化应用的生物医学发现进程。”生物医学研究推动了对发病机制、诊断方法和治疗手段的发现；然而，日益复杂的工作流程、不断扩充的数据集、专业化的工具以及激增的文献资料等都使得人们难以充分利用现有的知识和资源。由于对专家级研究人员的需求超出了现有的人力资源，宝贵的数据和分析机会因此往往未能得到充分利用。这凸显了开发能够扩展专业能力并加速科学发现之手段的必要性。AI 智能体的开发为重塑生物医学研究的多个方面带来了机遇，尤其是当此类工具能够处理范围广泛的生物医学任务时。 Huang 和同事在此推出了 Biomni，这是一种能够挖掘生物医学文献以综合定义“行动空间”的 AI 智能体。该大语言模型还能同时成为规划引擎，解读用户请求并准备一系列多步骤子任务以满足用户请求。凭借这种方式，Biomni 可以在没有预设模板的情况下编排工作流程并给予执行。作者在多种生物医学基准测试中对 Biomni 进行了评估。他们还评估了它在若干任务中与人类相比的表现；结果发现，Biomni 始终能达到专家水平的准确度，但所需时间则大幅缩短。他们还在 5 个案例研究中测试了这一工具；这些研究涵盖了从分析可穿戴传感器数据到设计实验方案以协助从事实体实验的研究人员。作者指出，尽管 Biomni 的运行环境涵盖了广泛的生物医学工具和数据库，“但其所评估的任务仅代表该领域的一部分，关键领域还未得到探索。”他们表示，即便如此，通过将复杂的工作流程自动化，“Biomni 可让研究人员将精力重新投入到创造性的假设生成、进行实验创新及开展跨学科的合作。”

研究人员在一项新的研究中报告称，一种栖息海拔高于所有其他哺乳动物的小鼠演化出了意想不到的适应机制，后者使其能够在从海平面到安第斯山脉之巅的环境中繁衍生息。据研究结果披露，安第斯叶耳鼠（Andean leaf-eared mouse）可借助一套独特的代谢与基因适应性组合（其中还包括一种出人意料的降解有毒植物毒性的能力）在极端环境中生存。安第斯叶耳鼠（Phyllotis vaccarum）是世界上栖息海拔最高的哺乳动物：它可在海拔超过 6700 米的地方生存。在这些海拔最高的地区，气温几乎常年处于冰点以下，氧气浓度则仅为海平面的 44% 左右，这会对哺乳动物的生存构成极大的生理挑战。然而，尽管环境如此恶劣，叶耳鼠依然能繁衍生息，其栖息地跨度可从海平面直至高海拔的山巅。使该物种得以独特地生活在如此令人难以置信的环境范围（包括安第斯山脉稀薄、冰冷的空气）中的适应机制，目前尚不完全清楚。Schuyler Liphardt 和同事在此分析了从该物种整个海拔分布范围内的各地点采集的 167 只叶耳鼠的全基因组测序数据。这些标本分别在中安第斯山脉的 5 次极端高海拔考察和其他的低至中海拔高度的调查中采集的。Liphardt 等人将高海拔小鼠个体与低海拔小鼠及一种近缘低地物种进行了比较，并通过模拟寒冷、低氧条件的实验室实验发现，高海拔叶耳鼠产生的体热显著更多，其肌肉和产热棕色脂肪的活性也更高，反映出它们在缺氧环境下也具备更强的保暖能力。令人惊讶的是，这些小鼠并未依赖许多在其他高海拔哺乳动物中常见的氧气运输适应机制（例如改变血红蛋白）。相反，它们似乎依赖于另一套不同的生理和遗传适应机制；这些机制可以提高能量产生、调节血管并帮助其在长期缺氧的状态下维持机体功能。群体基因组学分析发现，尽管高海拔与低海拔叶耳鼠之间存在大量的基因流动，但高海拔叶耳鼠的这些适应性特征仍然得以保留。作者还发现，基因组结构变异似乎并未导致这种适应性。出乎意料的是，基因组证据揭示，参与植物源性化合物解毒的通路得到广泛的选择，表明该物种还演化出了代谢有毒植物的能力。这表明，摄食生态学在海拔相关适应中发挥的作用可能比之前所认识到的要大得多。

对狼疮患者血液和尿液中 T 细胞的一项新的分析表明，浸润肾脏的 T 细胞会如何促成增生性狼疮肾炎（LN）中的炎症和损伤；LN 是狼疮的一种可导致肾衰竭的严重并发症。此前，这些 T 细胞在导致肾损伤中的确切作用尚不明确，这限制了对 LN 疗法的开发。如今，Christopher Skopnik 和同事对 LN 中肾脏浸润性 T 细胞的可能来源进行追踪，并展示了它们如何在肾脏中被激活。Skopnik 等人对 108 名 LN 患者的外周血和尿液中采集的 T 细胞进行了单细胞 RNA 测序，其中的尿液样本被用作反映肾脏浸润细胞情况的替代样本。他们发现，在狼疮性肾炎中，循环中的 CD8+CX3CR1+ T 细胞会被招募至发炎的肾脏；这些细胞似乎不具有自身反应性，而是会被细胞因子 IL-15 和 IFN-β 所激活。这种激活会触发 T 细胞产生其他炎性细胞因子，从而对肾脏过滤系统中的肾小管上皮细胞造成损伤。研究人员还指出，尿液中的 T 细胞对可能处于潜伏状态的 EB 病毒和巨细胞病毒抗原具有反应性，这为某些病毒可能会助长狼疮等自身免疫性疾病的观点提供了进一步的支持。