image: Schematic representation of sleep-microbiome interactions through the microbiota-gut-brain axis. Signals originating from the gut microbiome influence the sleep-wake cycle by modulating the flip-flop switch that governs these states. Sleep-promoting signals, such as butyrate, GABA, and melatonin, are received by sleep-related nuclei, while wakefulness-related signals, including 5-HT, orexin (ORX), and histamine (His), are detected by the sleep-related nuclei. The microbiota-gut-brain axis regulates sleep and wakefulness via three key pathways: Immune pathways, gut-derived immune factors are transmitted via the bloodstream and vagal afferents to modulate immune responses and microglial activation, affecting sleep regulation; Neural pathways, where gut microbes and their metabolites impact the enteric nervous system (ENS) and interact with afferent vagal pathways to influence sleep-related brain regions and circuits. Besides, the gut microbiota and their metabolites are also able to send signals to sleep-related brain regions through hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA) axis. Metabolic and endocrine pathways, gut-derived neurotransmitters, and metabolites, such as bile acids (BAs) and short-chain fatty acids (SCFAs), can influence sleep through systemic circulation. Additionally, stress-induced activation of the HPA axis can alter sleep and gut microbiota composition. The regulation of sleep by central and peripheral signals maintains a dynamic balance, with bidirectional interactions between sleep and gut microbiota supporting optimal function. GABA, γ -aminobutyric acid; MT, melatonin; His, histamine; 5-HT, 5-hydroxytryptamine; ORX, orexin; HPA, hypothalamic-pituitary-adrenal axis; ACTH, adrenocorticotrophic hormone; BAs, bile acids; SCFAs, short-chain fatty acids.
Credit: Lin Lu
ニューヨーク、ニューヨーク、2025年11月4日 – 本日Brain Medicineに掲載された包括的総説が、腸内細菌叢と睡眠調節との複雑な関連性を明らかにし、マイクロバイオータ-腸-脳軸を睡眠障害の理解と潜在的治療における重要な経路として確立した。北京大学第六医院のLin Lu教授と、中国および米国の研究機関にまたがる国際的な共同研究チームによって主導されたこの研究は、消化器系に存在する数兆の細菌が睡眠覚醒サイクルに直接的および間接的にどのように影響を与えるかについての現在の知見を統合している。
睡眠障害は世界中で数百万人に影響を及ぼしており、慢性不眠症や閉塞性睡眠時無呼吸から概日リズム障害に至る様々な状態が、身体的健康、認知機能、情緒的幸福に著しい影響を与えている。睡眠は生命の基本的な生理学的基盤として認識され、全体的な健康の維持において極めて重要な役割を果たしているものの、睡眠調節の完全な複雑性は不完全にしか理解されていない。睡眠を調節する中枢神経系のメカニズムを解明する大きな進歩があった一方で、本総説は、末梢臓器、特に消化器系が脳機能と行動の調節において果たす重要でありながらしばしば見過ごされる役割を明らかにしている。
マイクロバイオータ-腸-脳の関連
ヒト腸管は、多様な微生物生態系を宿しており、これらは複数の経路を通じて中枢神経系と双方向に交信している。これらには、迷走神経を介した直接的な神経接続、免疫系シグナル伝達、血液脳関門を通過可能な生理活性代謝物の産生が含まれる。「腸内細菌叢は、神経学的および精神医学的健康における主要な担い手として認識が高まっています」とLu教授は説明する。「我々の総説は、腸内細菌叢組成の破綻が複数の疾患における睡眠障害と密接に関連していることを実証しています。」
研究チームは、ヒト臨床研究と動物モデルからのエビデンスを検討し、睡眠障害を有する個人における微生物ディスバイオーシス(腸内細菌群集の不均衡)の一貫したパターンを明らかにした。特筆すべきことに、慢性不眠症患者は、健常対照と比較して微生物多様性の低下と特定の細菌科の存在度変化を示す。閉塞性睡眠時無呼吸においても同様のパターンが現れ、有益細菌のレベル低下が疾患重症度と相関している。
マイクロバイオーム研究における最近の進歩は、単純な相関研究を超えて、マイクロバイオームと睡眠関連状態との分子レベルでの関連を明らかにする仮説主導型調査へと進展している。これらの展開は、マイクロバイオータが睡眠にどのように影響を与えるかを理解し、睡眠障害を効果的に治療するための標的療法を開発するために不可欠である。
腸と睡眠を結びつけるメカニズム
本総説は、腸内細菌叢が睡眠調節に影響を与えるいくつかの生物学的経路を特定しており、代謝的、神経学的、免疫学的相互作用の複雑なネットワークを形成している。微生物代謝物は中心的な役割を果たしており、短鎖脂肪酸である酪酸などは、複数の研究において睡眠障害に対する保護効果を示している。これらの化合物は、食物繊維の細菌発酵を通じて産生され、炎症を調節し、腸管バリアを強化し、睡眠に重要な神経伝達物質系に影響を与えることができる。臨床試験では、酪酸ナトリウム補給が活動性潰瘍性大腸炎患者の睡眠の質を改善することが示され、一方、動物研究では酪酸が睡眠剝奪によって誘発される炎症反応と記憶障害を軽減することが実証されている。
胆汁酸は、睡眠に影響を与える別の重要な微生物代謝物クラスを代表する。研究によれば、慢性不眠症は、ムロコール酸やノルコール酸を含む一次胆汁酸のレベル上昇と、イソリトコール酸、リトコール酸、ウルソデオキシコール酸などの二次胆汁酸の減少に関連している。このパターンは、特定の腸内細菌集団、特にルミノコッカス科種の存在度低下と相関しており、睡眠剝奪個体における心代謝疾患リスクに寄与する可能性がある。これらの知見は、マイクロバイオータ-胆汁酸軸が慢性不眠症の心血管代謝健康への影響において重要な役割を果たすことを示唆している。
マイクロバイオータはまた、睡眠調節に直接関与する神経伝達物質の産生にも影響を与える。ラクトバチルス属やビフィドバクテリウム属の株を含む特定の腸内細菌は、グルタミン酸脱炭酸酵素をコードする遺伝子を保有しており、これは睡眠を促進する主要な抑制性神経伝達物質であるガンマアミノ酪酸(GABA)の産生を促進する。脳波検査を用いた研究では、GABAの経口摂取が脳応答の変化を誘発することが示されており、腸を介して産生または補給されたGABAが中枢神経系活動と睡眠構築に影響を与える可能性を示している。
さらに、体内のセロトニンの九十パーセント以上が腸で合成されており、腸内細菌が主要な産生者として機能し、特に新生児腸管において顕著である。セロトニン濃度は睡眠覚醒サイクル中にリズミカルに変動し、覚醒時にピークを迎え、レム睡眠中に最低レベルに達する。睡眠剝奪マウスは、セロトニンとメラトニンの両方の前駆体であるトリプトファン代謝の変化を示し、これらの変化はマイクロバイオームに依存し腸に局在している。消化管はまた、メラトニンの最も重要な松果体外源であり、その濃度は血漿中に見出されるものの最大四百倍に達し、概日リズムと睡眠の調節における腸の重要な役割を強調している。
睡眠障害全般にわたるエビデンス
本総説は、主要な睡眠障害における微生物変化を系統的に検討し、障害特異的な変化と収束的パターンの両方を明らかにしている。最も有病率の高い睡眠障害である不眠症において、数千人の参加者を含む研究は、有益細菌属の一貫した減少と代謝物プロファイルの変化を明らかにしている。六千三百九十八人の参加者を対象とした画期的研究では、慢性不眠症患者と健常者との間で微生物ベータ多様性に有意な差が認められ、慢性不眠症は特定のルミノコッカス科種の低レベルと関連していた。これらの細菌変化は、胆汁酸変化を通じて慢性不眠症と心代謝疾患との逆相関を媒介していた。
閉塞性睡眠時無呼吸患者は、アルファ多様性(微生物生態系の健全性の指標)の減少を示し、特定の細菌分類群が無呼吸低呼吸指数や酸素飽和度パラメータを含む臨床重症度マーカーと相関している。閉塞性睡眠時無呼吸の小児および成人は、ルミノコッカス科の存在度低下を示しており、これがこの状態の比較的頑健な特徴である可能性を示唆している。動物モデルはさらに、閉塞性睡眠時無呼吸の病態生理を模倣する慢性間欠的低酸素が、腸内細菌叢組成を著しく変化させながら全身性炎症マーカーを増加させ、腸管炎症の上昇を示すことを実証している。
交代勤務労働者や慢性時差ぼけの個人が経験するものを含む概日リズム障害は、明確な微生物シグネチャーを示す。夜勤労働者のヒト研究では、門レベルでのアクチノバクテリアとファーミキューテスの存在度増加が明らかになり、腸透過性亢進と炎症指標に関連するドレア・ロンギカテナやドレア・フォルミシジェネランスを含む特定の種が、わずか二週間の夜勤勤務後に増加を示している。動物モデルは、概日リズムの不一致がバクテロイデーテスやベルコミクロビアを含む特定の細菌門におけるリズミカルな振動を引き起こすことを明らかにし、マイクロバイオームが障害された概日リズムに適応し、潜在的にこれを永続化させることを示唆している。さらに、グルコース不耐性と相関する代謝経路が概日リズム不一致マウスで上方調節されており、腸内ディスバイオーシスを代謝機能不全と結びつけている。
おそらく最も興味深い知見は、ナルコレプシーとレム睡眠行動障害におけるものである。これらの神経学的状態は、健常者と比較して微生物群集に有意な差を示し、一部の細菌存在度が症状の重症度や睡眠構築の測定値と相関している。ナルコレプシー一型では、患者はクレブシエラの存在度増加と、ブラウティア、バーネシエラ、ラクトコッカスなどの有益属の減少を示す。レム睡眠行動障害がパーキンソン病などの神経変性疾患に数年から数十年先行することが多いことを考えると、これらの微生物バイオマーカーは早期発見の機会を提供する可能性がある。最近の研究では、ブチリシコッカスとフィーカリバクテリウムの減少が、レム睡眠行動障害からパーキンソン病への表現型転換の潜在的な特徴として同定されており、腸内細菌叢の変化が疾患進行を追跡することを示唆している。
睡眠障害と神経精神医学的併存症
本総説は、睡眠障害がうつ病、不安障害、自閉スペクトラム症、神経変性疾患を含む神経精神医学的状態に一般的に伴うことを強調している。これらの場合、腸内細菌叢の変化は、共有される炎症経路や神経伝達物質経路を通じて、一次精神医学的状態と併存睡眠問題の両方に寄与する可能性がある。例えば、ブラウティア、コプロコッカス、ドレアを含む特定の細菌属は、大うつ病性障害患者の睡眠の質指標と相関し、一方インテスティニバクターは睡眠の質と不眠症の重症度の両方との関連を示している。
自閉症と睡眠障害を持つ小児は、多様性指数の増加とフィーカリバクテリウムおよびアガトバクターの存在度低下を含む、明確な微生物プロファイルと代謝物異常を示す。これらの小児はまた、メラトニンレベルの低下とセロトニンレベルの上昇を示しており、腸の健康と睡眠障害を結びつける神経伝達物質の変化を示唆している。睡眠質問票スコアとフィーカリバクテリウム存在度との間の有意な負の相関は、睡眠調節におけるこの有益細菌の潜在的役割を強調している。
レム睡眠行動障害や不眠症を含む睡眠障害を頻繁に呈するパーキンソン病では、患者は腸内細菌叢の特徴的な変化を示す。典型的には運動症状の前に睡眠障害を含む非運動症状を呈する体幹型パーキンソン病患者は、大腸菌とアッカーマンシア・ムシニフィラの増加と短鎖脂肪酸産生共生細菌の減少によって特徴づけられる、特に明確な腸内マイクロバイオームプロファイルを示す。
治療的意義
メカニズム的理解に基づいて、本研究は睡眠改善のための新興マイクロバイオータ標的介入を検討しており、プロバイオティクスとプレバイオティクスから糞便微生物移植に至る。プロバイオティクス(生きた有益細菌)は、多様な集団にわたる複数の臨床試験で有望性を示している。特定の株は、慢性不眠症患者において睡眠の質の改善、コルチゾールレベルの低下、睡眠構築の改善において有効性を実証している。例えば、ラクトバチルス・プランタラムPS128は、N3睡眠中のデルタパワーを増強することにより、慢性不眠症患者の睡眠の質を改善し、より深く回復的な睡眠を反映した。ビフィドバクテリウム・ブレーベCCFM1025は、不眠症の個人においてコルチゾールレベルを有意に低下させ、主観的睡眠の質を改善し、プロバイオティクスが視床下部-下垂体-副腎軸の過活動を減弱させる能力を示している。
プロバイオティクスはまた、パーキンソン病患者の睡眠障害にも有益であり、ビフィドバクテリウム・アニマリス亜種ラクティスProbio-M8がパーキンソン病睡眠スケールスコアの有意な改善を実証している。さらに、物質使用障害のある個人は有望な結果を示し、ラクトバチルス・アシドフィルスがプラセボと比較してピッツバーグ睡眠質指数スコアのより大きな減少を生み出し、プロバイオティクスが物質使用と離脱に関連する睡眠障害を改善する治療的潜在力を持つ可能性を示唆している。
動物研究は、補完的なエビデンスとメカニズム的洞察を提供している。ラシドフィル補給は、光周期の後半における非急速眼球運動睡眠の長さを増強し、睡眠の質の向上に寄与した。ビフィドバクテリウム・アニマリスBB-12はラットにおいて睡眠効率を向上させ不安様行動を減少させ、一方プロバイオティクス発酵発芽複合体は、神経伝達物質と炎症因子レベルの調節および腸内フローラ組成の改善を通じて、マウスにおける睡眠持続時間を増強し不安様行動を減少させた。
選択的に有益腸内細菌を栄養するプレバイオティクスは、増加するエビデンスを伴う別の治療手段を代表する。研究では、プレバイオティクス補給が胆汁酸代謝を調節し、炎症を低減し、概日リズム障害後の睡眠指標を改善できることが示されている。無作為化対照試験では、十二週間にわたる部分加水分解グアーガム補給が健常高齢者の睡眠インベントリースコアを有意に改善し、一方、二型糖尿病女性に投与された難消化性デキストリンは睡眠の質スコアの好ましい改善をもたらした。
動物モデルでは、プレバイオティクス食が概日リズムの課題中のNREM睡眠のより迅速な再調整を促進し、ストレス後のREM睡眠回復を促進する。食事性プレバイオティクスは、ラットにおける腸内細菌叢の特定の代謝物に影響を与えることによりNREM睡眠を向上させ、パラバクテロイデス・ディスタソニスの相対的存在度が明暗逆転中の中核体温再調整サイクルとの関連を示した。これらの知見は、プレバイオティクスが、炎症と概日リズムの調節を通じて、睡眠喪失によって影響を受ける腸生理、認知行動、運動パフォーマンスを改善できることを示している。
プロバイオティクスとプレバイオティクスの組み合わせであるシンバイオティクスは、有益微生物とその好ましい基質の両方を提供することにより相乗的利益を提供する可能性がある。最近の臨床試験は、シンバイオティクス製剤が急性後COVID-19症候群患者および睡眠障害を特徴とする他の状態において睡眠の質を有意に改善することを実証している。ビフィドバクテリウムおよびラクトバチルス種をプレバイオティクスイヌリンおよびオリゴ糖、さらにポストバイオティクス抽出物と組み合わせた一研究では、睡眠障害を有する参加者において八週間後にピッツバーグ睡眠質指数スコアを有意に低下させた。ガラクトオリゴ糖、キシロオリゴ糖、難消化性デキストリンを含むビフィドバクテリウム株を含む別のシンバイオティクス調製物は、急性後COVID-19症候群患者の不眠症症状を軽減し、シンバイオティクス群でプラセボと比較してより多くの患者が不眠症緩和を経験した。
おそらく最も劇的なのは、健常ドナーからの糞便微生物移植が小規模臨床研究で顕著な有効性を示したことであり、腸内マイクロバイオームバランスを回復するためのより包括的なアプローチを代表している。他の慢性疾患と併存する慢性不眠症患者は、糞便微生物移植治療後に不眠症の重症度と睡眠の質スコアに有意な改善を経験し、症状スコアと負の相関を示すラクトバチルスおよびビフィドバクテリウムの相対的存在度の増加を伴った。同様に、線維筋痛症患者は、六か月の治療後に対照群と比較して糞便微生物移植群で有意に低い睡眠の質スコアを示した。
不眠症を伴う急性後COVID-19症候群患者では、糞便微生物移植が対照群と比較して有意に高い不眠症寛解率をもたらし、治療後に不眠症の重症度、睡眠の質、眠気スコアに実質的な改善が認められた。小児集団においてさえ、糞便微生物移植は自閉スペクトラム症の小児における睡眠障害スコアの十パーセント減少をもたらし、年齢層と多様な睡眠関連状態にわたるその潜在力を強調している。
比較エビデンスと今後の考察
マイクロバイオータ標的療法を比較する直接的な無作為化試験はまだ実施されていないが、既存のエビデンスは、各アプローチが明確な利点を提供することを示唆している。プロバイオティクスは良好な安全性プロファイル、アクセシビリティ、規制上の受容性を実証しており、短期的には広範な臨床使用に最も適している。プレバイオティクスも同様に優れた安全性と実施の容易さを提供する。シンバイオティクスはこれらの利点を組み合わせながら、相乗的メカニズムを通じて強化された有効性を提供する可能性がある。糞便微生物移植は、一部の患者において劇的な効果を示すものの、ドナースクリーニング要件、処理の標準化、感染リスク、規制上の制限を含む重大な障壁に直面しており、研究環境や難治性症例により適切である。
今後の研究は、これらのマイクロバイオータ標的療法の相対的利点、リスク、治療的妥当性を解明するために、直接比較試験、費用対効果研究、長期安全性データを重視すべきである。個人の反応変動性を理解し予測バイオマーカーを特定することは、睡眠のためのマイクロバイオームベース介入への個別化アプローチを開発するために不可欠となるであろう。
今後の研究方向
著者らは、観察から臨床応用へと移行するように設計された四つの段階的レベルを通じてマイクロバイオームと睡眠の研究を前進させるための系統的枠組みを提案している。第一レベルは、機能的磁気共鳴画像法や脳波検査などの神経画像技術、ポリソムノグラフィーとアクチグラフィーを用いた睡眠評価、糞便サンプルからの包括的マイクロバイオームプロファイリングおよび血液、唾液、尿のメタボローム解析を含む多様式評価を通じた関連の確立を含む。
第二レベルは、16S rRNAシーケンシング、メタゲノム解析、メタボロミクス、臨床データを含むマルチオミクスデータの機械学習統合を用いたバイオマーカーの特定に焦点を当てており、大規模データセットを解析する。これらのアプローチは、睡眠障害に関連する微生物シグネチャーと機能経路の分類を可能にし、睡眠障害を理解し個別化された診断および治療戦略の基盤を築くための貴重な標的を提供する。
第三レベルは、動物モデルにおける糞便微生物移植研究とヒト介入試験を通じた因果関係の確立を強調している。睡眠障害を有する個人から無菌動物または抗生物質処理動物へ腸内微生物群集を移植することにより、研究者は睡眠表現型を生み出す因果的微生物株を特定できる。腸内マイクロバイオームの複数サンプリングと機械学習手法と組み合わせた縦断的介入研究デザインは、睡眠障害が微生物組成と機能に及ぼす影響を解明するための重要な時系列データを生み出すことができる。
第四かつ最終レベルは、睡眠障害の改善における治療効果を評価するための厳密な無作為化対照試験とクロスオーバー研究を通じたマイクロバイオームベース介入の開発を含む。これらの介入には、プロバイオティクスなどの特定微生物、または短鎖脂肪酸やその他の微生物由来化合物を含むそれらの生理活性代謝物が含まれる可能性がある。構築と質を含む睡眠パラメータは、ポリソムノグラフィー、アクチグラフィー、主観的評価を用いて評価されるべきであり、治療効果の基礎となるメカニズムを解明するために、神経炎症マーカー、神経伝達物質レベル、腸内細菌叢組成解析とともに実施されるべきである。
「重要な進歩が達成されましたが、重要な課題が残っています」とLu教授は指摘する。「治療アプローチを検証し個人の反応変動性を理解するためには、標準化された方法論を用いたより大規模で十分に管理された臨床試験が必要です。サンプル収集とDNA抽出から睡眠評価ツールに至る、研究間での技術の調和により、意味のある研究間比較が可能になり、臨床実践への変換が加速されるでしょう。」
本総説は、臨床応用への前進には、マイクロバイオームシーケンシングにおける技術的変動性、プロバイオティクスとプレバイオティクスへの反応における個人間差異、限定的な長期安全性データを含む方法論的課題への対処が必要であることを強調している。今後の研究は、慢性不眠症や閉塞性睡眠時無呼吸などの最も強いメカニズム的関連を有する障害に対する介入試験を優先し、研究間で主要なバイオマーカーを標準化し、妥当な比較を可能にするために方法論を調和させるべきである。
結論
この包括的総説は、マイクロバイオータ-腸-脳軸を睡眠調節における重要でありながら過小評価されている因子として確立し、複数の睡眠障害と神経精神医学的状態にわたるエビデンスを統合している。相関研究、メカニズム的調査、治療的介入からの収束的エビデンスは、腸内細菌叢ディスバイオーシスが睡眠障害から生じるとともにこれに寄与し、不良な睡眠と関連する健康問題を永続化させる潜在的な悪循環を作り出すことを示している。
ファーミキューテス/バクテロイデーテス比の増加、アクチノバクテリアとコリンセラのレベル上昇、バクテロイデス、ビフィドバクテリウム、フィーカリバクテリウムなどの有益属の存在度低下を含む、複数の睡眠障害にわたる収束的変化の同定は、これらの変化が障害された睡眠の共通の微生物的基盤または結果を代表し、睡眠障害患者でしばしば観察される全身性炎症と代謝調節不全に潜在的に寄与する可能性を示唆している。
研究がこれらの複雑な相互作用を照らし続ける中、マイクロバイオータ標的介入は、睡眠障害の世界的負担に対処するための有望なフロンティアを代表しており、全体的な脳の健康、代謝機能、生活の質に対する利益を潜在的に提供する。本総説で提示されたエビデンスは、特定の睡眠障害と個々の患者特性に合わせた精密プロバイオティクス、最適化プレバイオティクス、個別化シンバイオティクス製剤を開発するための強固な基盤を提供している。
腸内細菌叢と睡眠との関係のより深い理解は、睡眠障害の管理と全体的な脳の健康の向上のための革新的アプローチへの道を開き、臨床医がこれらの有病率が高く衰弱させる状態にアプローチする方法を潜在的に変革するであろう。
論文および雑誌情報
Brain Medicineに掲載された「Brain-gut-microbiota interactions in sleep disorders」と題する総説論文は、2025年11月4日にBrain Medicineにおいてオープンアクセスを介して以下のリンクから無料で入手可能である: https://doi.org/10.61373/bm025i.0128。
本研究はSTI2030-Major ProjectsおよびNational Natural Science Foundation of Chinaにより支援された。
Brain Medicineについて:Brain Medicine(ISSN:2997-2639、オンライン、および2997-2647、印刷)は、Genomic Press(ニューヨーク)により発行される高品質医学研究雑誌である。Brain Medicineは、基礎神経科学における革新からブレインメディシンにおける橋渡し研究的取り組みへの学際的経路のための新たな拠点である。本誌の範囲には、脳障害の基礎科学、原因、アウトカム、治療、および社会的影響が、すべての臨床分野とその境界領域にわたって含まれる。
Genomic Press Virtual Libraryを訪問: https://issues.genomicpress.com/bookcase/gtvov/
完全なウェブサイトは以下: https://genomicpress.com/
Journal
Brain Medicine
Method of Research
Literature review
Subject of Research
People
Article Title
Brain-gut-microbiota interactions in sleep disorders
Article Publication Date
4-Nov-2025
COI Statement
The authors declare that they have no conflict of interest.