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Stresshormone bringen wichtige Gehirngene durch Chromatin-gebundene RNAs zum Schweigen, zeigt Studie

Neue Forschung unter Leitung von Professor Yogesh Dwivedi an der University of Alabama at Birmingham deckt auf, wie lange nicht-kodierende RNAs die Chromatin-Silencing-Maschinerie unter Glukokortikoidrezeptor-Aktivierung aktivieren und die Stressbiologie

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Role of lncRNAs in stress-associated gene regulation following chromatin silencing: Mechanistic insights from an in vitro cellular model of glucocorticoid receptor gene
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Credit: Yogesh Dwivedi

BIRMINGHAM, Alabama, USA, 4. November 2025 — Was wäre, wenn die Reaktion des Gehirns auf Stress nicht in flüchtigen Neurotransmitter-Ausbrüchen abgelesen werden könnte, sondern im Verstummen von Genen tief in der Chromatinstruktur? Forscher der University of Alabama at Birmingham haben nun gezeigt, dass Stresshormone entscheidende neuronale Gene durch eine unerwartete Klasse von RNA-Molekülen zum Schweigen bringen können, die nicht durch Kodierung von Proteinen operieren, sondern durch Umgestaltung der Genomarchitektur.

Stress, das Genom und eine verborgene Regulationsebene

Die Studie, geleitet von Professor Yogesh Dwivedi, Distinguished Professor und Elesabeth Ridgely Shook Endowed Chair im Department of Psychiatry and Behavioral Neurobiology, deckt auf, wie lange nicht-kodierende RNAs (lncRNAs) mit dem Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) assoziieren, um Chromatin nach Aktivierung des Glukokortikoidrezeptors (GR) zu modifizieren, dem Hauptregulator der zellulären Stressantwort.

In den Worten von Professor Dwivedi: "Unsere Ergebnisse weisen auf einen strukturellen Weg hin, über den Stresshormone die Genexpression beeinflussen. Wir beobachteten, dass spezifische lncRNAs mit Polycomb-Proteinen assoziieren, um benachbarte Gene zum Schweigen zu bringen, darunter viele, die mit synaptischer Funktion verbunden sind. Dies ist nicht nur transkriptionelles Rauschen, es ist die Architektur des Stresses selbst".

Die wissenschaftliche Herausforderung

Stress ist sowohl adaptiv als auch destruktiv. Wenn er kurz ist, schärft er den Fokus und mobilisiert Energie. Wenn er verlängert ist, konfiguriert er das Gehirn um, erodiert die Resilienz und trägt zu Störungen wie der Major Depression (MDD) bei. Während Jahrzehnte der Forschung dokumentiert haben, wie Stresshormone die Hypothalamus-Hypophysen-Nebennieren-Achse (HPA-Achse) aktivieren, haben Wissenschaftler Schwierigkeiten gehabt, genau zu bestimmen, wie diese vorübergehenden Signale dauerhafte molekulare Spuren hinterlassen.

Epigenetik, vererbbare Veränderungen der Genaktivität ohne Veränderung der DNA-Sequenz, hat sich als Hauptverdächtiger herauskristallisiert. Insbesondere ist bekannt, dass der Glukokortikoidrezeptor, der die Wirkungen von Cortisol vermittelt, in den Zellkern eintritt und die Transkription beeinflusst. Doch genau wie die GR-Aktivierung eine dauerhafte Repression neuronaler Gene erzeugt, blieb eine offene Frage.

Könnten lncRNAs die fehlenden Vermittler sein? Diese rätselhaften Moleküle kodieren keine Proteine, binden aber an Chromatin-modifizierende Komplexe und leiten effektiv, wo und wann das Genom geöffnet oder geschlossen wird.

Ein mechanistisches Experiment im Miniaturformat

Um dies zu untersuchen, konstruierte das Dwivedi-Team ein kontrolliertes Modell anhaltender Stress-Signalübertragung. Unter Verwendung von SH-SY5Y-Neuronenzellen überexprimierten sie das Glukokortikoidrezeptor-Gen (NR3C1) und erreichten eine kontinuierliche GR-Aktivierung ohne die pharmakologische Variabilität hormoneller Stimulation. Diese Konfiguration imitierte die chronische, dysregulierte HPA-Achsen-Aktivität, die für stressbedingte Störungen charakteristisch ist.

Die Forscher führten dann strangspezifische RNA-Sequenzierung (RNA-seq) durch, um die Expression von mehr als 12.000 lncRNAs zu kartieren. Unter GR-Aktivierung wurden 79 lncRNAs signifikant verändert (44 hochreguliert, 35 herunterreguliert; p kleiner als 0,05). Mehrere davon erschienen auf den Chromosomen 11 und 12, Regionen, die zuvor mit stressverbundenen transkriptionellen Veränderungen assoziiert wurden.

Dann kam ein kritischer Test: Könnten diese RNAs mit der Chromatin-Silencing-Maschinerie interagieren? Durch RNA-Immunpräzipitations-Sequenzierung (RIP-seq) unter Verwendung von Antikörpern gegen EZH2, die katalytische Untereinheit von PRC2, und H3K27me3, eine repressive Histon-Markierung, fand das Team heraus, dass 89 lncRNAs in der EZH2-gebundenen Fraktion und 57 in der H3K27me3-Fraktion angereichert waren.

"Diese RNAs scheinen wie Postleitzahlen für Genrepression zu wirken", sagte Dr. Anuj K. Verma, Hauptautor der Studie. "Sie helfen, den Polycomb-Komplex zu präzisen Chromatin-Nachbarschaften zu leiten, wo stressinduziertes Silencing auftritt".

Die doppelte Anreicherung unterstützt stark ein Modell, in dem GR-induzierte lncRNAs PRC2 zu Ziel-Loci rekrutieren, Histon-Methylierung fördern und lokales Gen-Silencing bewirken.

Vom molekularen Schweigen zur synaptischen Konsequenz

Als das Team lncRNA- und mRNA-Datensätze verglich, waren die Korrelationen auffallend. Genomweit verfolgten lncRNA-Spiegel invers die Transkription benachbarter Gene (R gleich minus 0,21, p kleiner als 0,005). Innerhalb reprimierter Chromatin-Domänen verstärkte sich diese Beziehung (r gleich minus 0,071 und minus 0,037, p kleiner als 0,0001) für lncRNAs, die an EZH2 bzw. H3K27me3 gebunden waren.

Herunterregulierte Gene gruppierten sich um synaptischen Vesikeltransport, Neurotransmitter-Rezeptorregulation und Calcium-Signalübertragung, dieselben Prozesse, die bei Depression und chronischem Stress gestört sind. Funktionelle Anreicherungsanalysen identifizierten Calcium-Signalübertragung (p kleiner als 0,01) und Glycosylphosphatidylinositol-Anker-Biosynthese (p kleiner als 0,05) als hauptsächlich betroffene Signalwege, wobei das Reactome-Mapping 33 veränderte Kaskaden aufdeckte, einschließlich der TrkA/TrkB-, FGFR- und PI3K-AKT-Signalwege.

Diese Signalachsen regulieren neuronale Erregbarkeit und dendritische Dornen-Integrität, Merkmale, die bei MDD beeinträchtigt sind. "Was entsteht, ist ein epigenetisches Echo des Stresses", sagte Dr. Bhaskar Roy, Koautor der Studie. "Die Stress-Maschinerie des Gehirns schaltet Gene nicht einfach an und aus; sie konfiguriert die Chromatin-Landschaft um, die entscheidet, welche Gene sich ausdrücken können".

Die Wissenschaft verstehen

Um die Befunde zu visualisieren, liefern die Autoren Heatmaps, Vulkan-Plots und chromosomale "Circos"-Diagramme, die die Verteilung hoch- und herunterregulierter lncRNAs illustrieren. Eine Netzwerkanalyse enthüllte sechs Hub-lncRNAs, die als Hauptknoten im stressinduzierten transkriptionellen Netzwerk fungieren. Unter diesen stachen drei hervor: ENSG00000225963.8, ENSG00000228412.9 und ENSG00000254211.6, jede unter GR-Aktivierung hochreguliert und sowohl in EZH2- als auch H3K27me3-Komplexen angereichert.

Diese RNAs können als Schlüsselgerüste wirken, die PRC2 an stressreaktive Loci verankern. Analog könnte man sie als molekulare Lesezeichen betrachten, die während des Stresses in das Genom eingefügt werden und markieren, welche Seiten lange nach dem anfänglichen Stimulus geschlossen bleiben sollen.

Von der Entdeckung zur Auswirkung

Die potenziellen Implikationen reichen weit über die Petrischale hinaus. Stressinduzierte Veränderungen der Chromatinstruktur wurden in eine Reihe psychiatrischer und neurodegenerativer Erkrankungen impliziert. Wenn spezifische lncRNAs diese Veränderungen vermitteln, könnten sie Biomarker für Stressvulnerabilität oder Ziele für Antidepressiva der nächsten Generation werden, die darauf abzielen, die Chromatin-Flexibilität wiederherzustellen.

Aktuelle Antidepressiva modulieren Neurotransmitter wie Serotonin oder Noradrenalin, aber ihr verzögerter Wirkungseintritt deutet auf eine tiefere molekulare Trägheit hin. Durch die Identifizierung nicht-kodierender RNAs, die physisch die Chromatin-Repression leiten, deutet diese Studie auf eine epigenetische Kontrollebene hin, die Medikamente eines Tages umkehren könnten.

Könnten Interventionen, die die lncRNA-PRC2-Interaktion modulieren, stillgelegte Gene, die an der Neuroplastizität beteiligt sind, wieder erwecken? Könnten zirkulierende RNA-Fragmente die Stressbelastung eines Individuums widerspiegeln? Solche Fragen könnten umgestalten, wie die Psychiatrie Resilienz konzeptualisiert, nicht nur als Bewältigungsverhalten, sondern als molekulare Anpassungsfähigkeit.

"Wenn wir Individuen identifizieren können, deren lncRNA-Profile maladaptive Chromatin-Reaktionen auf Stress vorhersagen, könnten wir früher eingreifen", bemerkte Professor Dwivedi. "Diese Vision bleibt in der Zukunft, aber diese Studie liefert die mechanistische Grundlage".

Das Team hinter der Entdeckung

Alle Autoren sind der Heersink School of Medicine der University of Alabama at Birmingham angegliedert. Das Projekt wurde durch mehrere Zuschüsse des U.S. National Institute of Mental Health unterstützt (R01MH130539, R01MH124248, R01MH118884, R01MH128994, R01MH107183 und R56MH138596). Das multidisziplinäre Team integrierte Expertise in Psychiatrie, Neurobiologie und computergestützter Genomik.

Einschränkungen und Vorbehalte

Die Forscher erkennen an, dass diese Ergebnisse aus einem zellulären Modell stammen und nicht ohne zusätzliche Validierung auf das menschliche Gehirn verallgemeinert werden sollten. Die berichteten Korrelationen sind statistische Assoziationen, keine kausalen Demonstrationen. Konfidenzintervalle wurden im Quellmanuskript nicht spezifiziert, obwohl p-Werte angegeben wurden. Funktionelle Tests, wie das Silencing oder die Überexpression der identifizierten lncRNAs in Neuronen, werden wesentlich sein, um Kausalität zu bestimmen.

Dennoch liefert die Integration der Studie von transkriptomischen, epigenomischen und genomweiten Chromatin-Daten eine der bisher klarsten mechanistischen Verbindungen zwischen Glukokortikoid-Signalübertragung und dauerhafter transkriptioneller Repression.

Der Weg nach vorne

Zukünftige Richtungen ergeben sich natürlich aus den Daten.

  • Können diese lncRNAs als im Blut nachweisbare Biomarker chronischer Stressexposition dienen?
  • Wie verhalten sie sich in Gehirnorganoiden, die von Patienten mit Depression abgeleitet sind?
  • Könnte die pharmakologische Störung der PRC2-lncRNA-Bindung pathologisches Silencing umkehren?
  • Könnte Stress in der frühen Lebensphase dauerhafte RNA-"Signaturen" im Chromatin hinterlassen, die für spätere Erkrankungen prädisponieren?
  • Und grundsätzlich: Kann die Manipulation dieser molekularen Vermittler die Stressresilienz verbessern?

Die Beantwortung solcher Fragen könnte die Suche nach Antidepressiva neu gestalten und sich nicht nur auf Synapsen konzentrieren, sondern auch auf den Chromatin-Code, der sie regiert.

Breiterer Kontext

In der breiteren Landschaft der psychiatrischen Forschung veranschaulicht die Arbeit, wie grundlegende Molekularbiologie den anhaltenden Schatten des Stresses beleuchten kann. Die Entdeckung einer GR-lncRNA-PRC2-Achse verbindet zwei Felder, Endokrinologie und Epigenomik, die sich historisch getrennt entwickelt haben. Sie unterstreicht auch, dass psychische Gesundheitsstörungen ebenso sehr Störungen der Informationsspeicherung wie der Emotion oder des Verhaltens sind.

Durch die Integration molekularer Präzision mit translationaler Relevanz stellt diese Studie einen Schritt dar, um zu verstehen, wie Stress nicht nur umgestaltet, wie wir uns fühlen, sondern wie sich unser Genom erinnert.

Abschließende Erklärung

Diese Originalforschung stellt einen bedeutenden Fortschritt in der Neuroepigenomik dar und bietet neue Einblicke in die Chromatin-assoziierte lncRNA-Aktivität durch rigorose experimentelle Untersuchung. Die Befunde liefern kritische Evidenz für das Verständnis der stressverbundenen transkriptionellen Regulation über eine GR-lncRNA-PRC2-Achse. Durch die Anwendung eines integrativen transkriptomischen und RIP-seq-Ansatzes hat das Forschungsteam Daten generiert, die nicht nur fundamentales Wissen vorantreiben, sondern auch praktische Anwendungen in der Biomarker-Entdeckung und mechanistischen Zielidentifikation nahelegen. Die Reproduzierbarkeit und Validierung dieser Befunde durch den Peer-Review-Prozess sichert ihre Zuverlässigkeit und positioniert sie als Grundlage für zukünftige Untersuchungen. Diese Arbeit veranschaulicht, wie Spitzenforschung die Lücke zwischen Grundlagenwissenschaft und translationalen Anwendungen schließen kann und in den kommenden Jahren potenziell Patienten, Kliniker und Forscher beeinflusst.

Diese bahnbrechende Originalforschung wurde als Titelartikel für Genomic Psychiatry ausgewählt, was ihre Bedeutung für das Feld der psychiatrischen Genomik widerspiegelt. Die Studie wird von einem Editorial der Drs. Julio Licinio und Ma-Li Wong begleitet, die diese Befunde im breiteren Kontext der Stressbiologie und psychiatrischen Forschung kontextualisieren. Das Editorial hebt hervor, wie diese Arbeit kritische Mechanismen beleuchtet, die Umweltstress mit persistenten Veränderungen in Genexpressionsmustern durch lncRNA-vermittelte Chromatin-Modifikationen verbinden.

Die umfassende Natur dieser Untersuchung, die mehrere RNA-Sequenzierungsmodalitäten und Netzwerkanalysen umspannt, liefert Einblicke, die neu gestalten werden, wie das Feld die lncRNA-vermittelte Chromatin-Regulation in Stress-Kontexten angeht. Darüber hinaus demonstriert die interdisziplinäre Zusammenarbeit zwischen molekularer Psychiatrie und Chromatin-Biologie die Kraft der Kombination vielfältiger Expertise zur Bewältigung komplexer wissenschaftlicher Fragen.

Artikel-Zitationen

Die Forschungsmitteilung hoher Priorität in Genomic Psychiatry mit dem Titel "Rolle von lncRNAs in der stressassoziierten Genregulation nach Chromatin-Silencing: Mechanistische Einblicke aus einem in vitro zellulären Modell der Glukokortikoidrezeptor-Gen-Überexpression" ist über Open Access am 4. November 2025 in Genomic Psychiatry unter folgendem Hyperlink frei verfügbar: https://doi.org/10.61373/gp025h.0107.

Das begleitende Editorial in Genomic Psychiatry mit dem Titel "Stress, Chromatin und lange nicht-kodierende RNA: Eine neue Grenze in der psychiatrischen Biologie" ist ebenfalls über Open Access am 4. November 2025 in Genomic Psychiatry unter folgendem Hyperlink frei verfügbar: https://doi.org/10.61373/gp025d.0110.

Über Genomic Psychiatry

Genomic Psychiatry: Advancing Science from Genes to Society (ISSN: 2997-2388, online und 2997-254X, print) repräsentiert einen Paradigmenwechsel in Genetik-Zeitschriften, indem sie Fortschritte in Genomik und Genetik mit Fortschritten in allen anderen Bereichen der zeitgenössischen Psychiatrie verwebt. Genomic Psychiatry veröffentlicht hochqualitative medizinische Forschungsartikel aus jedem Bereich innerhalb des Kontinuums, das sich von Genen und Molekülen über Neurowissenschaften, klinische Psychiatrie bis hin zur öffentlichen Gesundheit erstreckt.

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