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英矽智能与合作伙伴发现强效WDR5-MYC相互作用抑制剂

Peer-Reviewed Publication

InSilico Medicine

英矽智能与研究合作伙伴华东医药宣布,双方利用英矽智能创新生成式人工智能技术和基于物理的分子建模模块,成功发现强效靶向WD重复序列蛋白5(WDR5)-MYC蛋白质-蛋白质相互作用的新型小分子抑制剂。该研究发表于Chemical Biology & Drug Design

在高达70%的人类癌症中,MYC蛋白都是得到广泛认可的驱动因子,然而由于缺乏适合高亲和力小分子抑制剂的结合位点,MYC长期以来被认为是"不可成药"的。近期研究表明,MYC与WD重复序列蛋白5(WDR5)之间的相互作用对MYC的致癌活性至关重要,为药物开发提供了有前景的新治疗靶点。

此项研究中,团队首先利用生成式AI驱动的Chemistry42平台生成靶向WDR5的小分子抑制剂,随后通过基于配体的分子生成技术,结合锚点信息以保留关键药效团,最终发现了化合物8(IC50 = 16.35 μM)和化合物9(IC50 = 1.91 μM)。与参照化合物(IC50 = 20.86 μM)相比,这两种化合物的抑制活性均得到显著改善。

接下来,研究团队在Chemistry42基于物理的工具AlChemistry支持下,进一步优化已有苗头化合物。值得注意的是,其中一个名为9c-1的先导化合物与化合物3相比活性提高了35倍,达到了亚微摩尔结合亲和力。这个分子标志着重大进展,被确定为强效WDR5-MYC蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)抑制剂疗法的潜在候选化合物。

英矽智能化学与DMPK负责人,药物化学高级副总裁丁晓博士表示,“这项研究再次验证了英矽智能AI驱动平台为药物研发带来创新突破的可行性,特别是针对以前被认为不可成药的靶点。这样的积极结果不仅突出了生成化学模块与基于物理建模模块相结合的强大潜能,也体现了其将前沿科学转化为有前景治疗候选药物,进而满足患者未竟医疗需求的能力。”

2016年,英矽智能全球首次在同行评审期刊上阐述了使用生成式人工智能设计新型分子的概念,为涵盖生成生物学、化学和临床医学、科学等领域的商业化Pharma.AI 平台奠定了基础。通过整合先进的AI和自动化技术,英矽智能在实际应用案例中展现出效率提升,为AI驱动的药物研发树立了标杆。与传统药物研发通常需要2.5-4年的时间周期相比,英矽智能在2021至2024年间提名的22款自研项目,从立项到提名临床前候选药物(PCC)的平均耗时为12-18个月之间,每个项目仅需合成和测试约60-200 个分子。

 

参考资料

[1] Sun, W. et al. (2025) 'Discovery of novel inhibitors for WD Repeat‐Containing Protein 5 (WDR5)‐MYC Protein–Protein interaction,' Chemical Biology & Drug Design, 105(5). https://doi.org/10.1111/cbdd.70129.

 

关于英矽智能

英矽智能是一家由生成式人工智能驱动的全球先锋生物科技公司,利用其专有的 Pharma.AI 平台和先进的自动化实验室,加速药物发现并推动生命科学领域的创新。通过整合人工智能和自动化技术,英矽智能正在为纤维化、肿瘤学、免疫学、疼痛、肥胖和代谢紊乱等未满足的疾病领域提供创新药物解决方案。英矽智能由人工智能驱动发现的产品管线中,已有10个分子获得临床试验许可,其中进展最为领先的Rentosertib(原名ISM001-055)是一种潜在全球首创用于治疗特发性肺纤维化的候选药物,已完成2a期临床研究并获得令人鼓舞的积极结果。此外,英矽智能还在探索前沿领域,包括老龄化研究、可持续化学和农业创新方面的突破。

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